在单身旅行的白麟为了救从月台失足坠落的小女孩，被绿皮火车撞击失去意识，醒来时竟然穿越到1993年的巫师世界，并获得了神奇动物召唤图鉴：收集神奇动物，获得强大魔力与召唤兽。而他的身份则是一名神奇生物研究员，被派到霍格沃兹协助教学，也是魔法部安排的卧底。

七名天赋绝伦的少年，梦中进入仙山“琥珀”，转眼五年，背负了各自命运和志向的少年，带着从仙山学到的七门绝学，注定要搅乱这平静又复杂的人间。