而吉尔伽美什打算用天父的剑刃加上核为神薙裕强化神机，没想到剑刃倒是有了，核被希克扎尔扣下了，美名其曰“为人民服务”，呸，错了，是为了人类的未来……
但是没过几天，极东支部便打算向神盾岛发起战争。
在找到雨宫龙胆的手轮后，橘佐久夜拿出了一个u盘，插在终端上，经过雨宫龙胆手轮的验证，成功打开了这个u盘。
王逸看到后翻了一个白眼……
怪不得当初雨宫龙胆的终端里什么也查不到……原来都是放在u盘里了！
资料就算不看王逸也知道，u盘内的内容无非就是“方舟计划”！
方舟计划一瞬间传遍了整个极东支部，但是谁也没有上报给总部。
家丑不能外传，这是内部战争！
神薙裕倒是进了医务室，原因是被雨宫龙胆的神机反侵蚀了，藤木浩太正陪着他。
因为吉尔伽美什的全力维护，导致藤木浩太并没有和希克扎尔接触过，也就导致了他没有叛离第一部队。
原剧情中，藤木浩太被希克扎尔忽悠，希望方舟计划能够使自己的家人活下去，于是叛离了第一部队，但是最终悔悟了过来。
而希欧，此时正与索玛在一起，旁边则是站着吉尔伽美什。
不是她想当一个“电灯泡”，而是她必须看住希欧，自吉尔伽美什的房间之后，一旦没有她管住希欧，希欧便会“破墙而出”，至今为止，除了她的房间，就连榊博士的实验室，还有橘佐久夜的房间也接连被破坏……
希欧本人也不明白自己为何会失去对身体的控制权。
但是最近情况有所好转，自神盾岛那头拿到了天父的核之后，希欧便很少失去意识了。
吉尔伽美什觉得，可能是希克扎尔发现无法捕捉到特异点，就用天父的核替代了特异点。
……
几天后。
神薙裕已经休整完毕，众人也调整为最佳状态，准备向神盾岛进军。
现在极东支部群龙无首，再加上其他的不对需要捕猎荒神，保护极东支部，所以只能由第一部队前往神盾岛。
可是使众人感到意外的是，通往神盾岛的所有道路，全被封死了，那座唯一能够通往神盾岛的桥也被炸毁了。
众人束手无策，只好回到极东支部讨论对策。
然而吉尔伽美什却将雨宫椿叫了过来。
“椿，你知道的吧？”吉尔伽美什意有所指。
“果真是什么都瞒不住吉尔姐……”雨宫椿叹了一口气，看向第一部队，“基地因为‘方舟计划’变得乱七八糟，弟弟的行事不周，只能由我这个姐姐给他殿后……极东支部的地下有通道可以直达神盾岛。”
吉尔伽美什敲了一下她的脑袋，有些不满地说道：“不是还有我吗？”
“真是的，吉尔姐，”雨宫椿捂住脑袋，“就不能让我在部下们面前显得威严一点吗……”
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