这下可好，阿姆斯特丹号顿时偏离航向，一阵乱撞。有两艘西班牙式大帆船被阿姆斯特丹号猛烈撞击，引起船身破裂。海水立刻凶猛的倒灌进去，舰体开始快下沉。
失去了指挥官的荷兰舰队顿时陷入致命的混乱中
等郑芝龙率领舰队来到巴达维亚海面上时，停在港内的荷兰战舰一艘都不敢出战，于是郑芝龙率领大明水军大摇大摆的再巴达维亚的海滩上登6
才一上岸，就有士兵通报，说是李为经前来求见
郑芝龙一见到李为经顿时吓了一跳，“桥兄，为何这般模样？”只见李为经的头散乱，衣衫不整不说，身上，头上还占了不少干涸的血迹
“太惨了……太惨了！”李为经见到郑芝龙，立刻失声痛哭起来
“桥兄，你先别急着哭啊……你倒是说话啊！”郑芝龙急忙问道
李为经还是嚎了好一会儿，才哽咽地说道：“我自打从婆罗洲回到爪哇，就开始筹备起义的大事。可是不知道怎么的，荷兰人就听到了风声，以搜查军器为名，命令城内华侨交出一切利器，红毛鬼挨户搜捕华侨，不论男女老幼，捉到便杀，对我华民进行血腥洗劫。屠杀持续7天，城内华侨被杀近万人，侥幸逃出者仅150人，被焚毁和劫掠的华侨房屋达六、七百家，财产损失，无法估计。城外华侨在我们几个甲必丹的指挥下，与荷军激战，伤亡千余人。”
“可恶的红毛鬼！”郑芝龙一把推开李为经，噌地一声抽出雁翎刀，“诸将何在？”
“末将在！”在场的施大宣、刘国轩等人听了李为经的哭诉也是怒火中烧
施琅愤然道：“佛郎机人在吕宋杀我华民，荷兰红毛又在爪哇杀我华民，难道我大明子民是天生贱种，任尔屠戮？誓要血债血偿！”
这时，甘辉插口问道：“桥兄，红毛人有没有驱遣当地土人杀我华民？”
“有……”李为经擦了擦眼泪说道，“那些土人生性愚笨懒惰，嫉妒我华民勤劳致富，所以反比红毛鬼杀我华民更加心狠手辣。”
“这帮天杀的生番……”郑芝龙骂道：“那么咱们也学学安国公攻打吕宋的办法，用土人为先驱。”
于是，出现在马尼拉的一幕在巴达维亚重演，爪哇那些土人吓得要命，他们在大屠杀中敢于抢劫杀害华人，就是仗着有荷兰人人撑腰，如今大明的军队来了，这些从树上下来没几天的土人又一个个顿时吓得屁滚尿流。
于是，在明军的枪炮驱赶下，这些该杀千刀的土人举着沾满华民鲜血的武器蜂拥冲向巴达维亚，与受雇于荷兰人的土人进行厮杀。惨烈的战斗进行了七天七夜，巴达维亚城内外到处是土人的尸体。直到第九天，巴达维亚总督安东尼？范？迪门领着还没死的一百多名荷兰士兵和一千多平民向郑芝龙投降
郑芝龙用张远赐予的便宜行事之权，将投降的荷兰红毛在荷兰人屠杀华民的红溪边统统斩，还挖出他们的心肝祭祀死难的华民。随后，郑芝龙又把炮口对准了马六甲的荷兰余部。
听说巴达维亚都失陷了，马六甲的荷兰人一下子就失去了战意，他们派出使者向郑芝龙投降。
郑芝龙打算假意接受投降，然后再把这些荷兰人统统处死。这时，郑芝龙的部下冯澄世（冯锡范的老爹）建议道：“虽然安国公给了将军您便宜行事的权利，但是将军却不宜将这权利用尽。您在巴达维亚已经杀了不少荷兰鸿毛了，这点俘虏，依我之见，应该献给安国公，由他来决定处置，这样才显得您对他的尊重。”
郑芝龙静下心来一想，还真是这么个道理，于是把一千多荷兰俘虏装了四船，运回福建献给张远。
直到郑芝龙占领马六甲之后十多天，从印度赶来支援大明的葡萄牙舰队才姗姗来迟。见明军占了马六甲，葡萄牙舰队指挥官多佛尔便向郑芝龙提出，要大明向葡萄牙移交马六甲
郑芝龙乐了，笑道：“他娘的，老子辛辛苦苦地和荷兰红毛厮杀，你们过来吃现成的不说，还要我移交？这算什么道理？”
通晓荷兰语和葡萄牙语的李为经取掉了粗话，然后照实翻译了郑芝龙的话
多佛尔昂着头，骄傲地说道：“马六甲原本是葡萄牙的殖民地，后来被荷兰佬抢走。现在虽然是贵国收复了马六甲，但是我们是盟友，难道不应该把马六甲交还他的主人吗？”