首先是改变克里姆林宫醒目的颜色。因为从空中鸟瞰时，莫斯科市内建筑顶部呈现出的颜色主调是红色和褐栗色。而克里姆林宫的亮黄色以及内部建筑顶部的绿色让在莫斯科市区众多的建筑中非常抢眼。于是，克里姆林宫迅速被漆成了与莫斯科整体风格一致的红色，围墙上的塔楼和教堂圆顶都被漆成黑色。同时，还用颜料遮掩了教堂金顶上的闪光。
但克里姆林宫毕竟就是克里姆林宫。它独特的建筑风格和醒目的标志物并不是简单地靠颜色的改变就能掩人耳目的。于是，苏联人又把克里姆林宫围墙内的大部分建筑伪装成各种最普通的建筑，塔伊尼茨花园的部分建筑被蒙上了布，宫殿塔楼上的红星和教堂上的十字架等最明显的标志物也被蒙上了护套。
苏军在对克里姆林宫进行伪装的同时，还布置了一个假的克里姆林宫，来了一个隐真示假，以假掩真。还在假克里姆林宫的周围还仿制了红场和马涅日广场的部分轮廓，看起来就更像真的了。
但是苏联人又发现，克里姆林宫内的道路和桥梁还是能够呈现出特殊的建筑脉络，从而暴露了真克里姆林宫的迹象。于是，又对对克里姆林宫围墙内的道路、桥梁进行全面改装和伪装。克里姆林宫内从博罗维茨大门到救世主塔楼之间的通道被洒上了泥土和沙子，从空中看上去，就像是一条普通的公路。克里姆林宫靠近莫斯科河的拐弯处也被改变了往常的形状，在列茨大桥和大石桥间还造了一座木桥。列宁墓的外形也被改装得让人无法辨认，墓室左右两边的讲台上都蒙上了巨大的红幅，墓室上方则搭建起了一个有3层楼高的木制模型。
不仅是克里姆林宫，苏军还对整个莫斯科市区从空中看具有参照价值的地形地貌都进行了伪装，甚至连莫斯科的主要街道的位置都通过伪装和改建改变了，这也是苏军在城市防空中最具有创意的方法。毫不夸张地说，德军飞机飞行员在空中看到的所有一切都是假的，这还怎么可能炸到克林姆林宫？
德军虽然对莫斯科进行了多次空袭，但始终无法从空中识破苏军的伪装，发现真正的克里姆林宫。
1943年之后，随着德军空中力量在战争中的损失越来越多，以及地面防线也越来越远离莫斯科，德军对莫斯科的空袭也最终画上了句号。
所以并不是德军不想轰炸克林姆林宫，而是受到当时导航定位技术条件的限制，加上苏军的巧妙伪装，严密而卓有成效的对空防御，才最终成功地将克里姆林宫基本完好地保护了下来。
斯大林听到斯皮里多诺夫少将的保证，满意的点点头。“很好，那就不用进防空洞了。”
可万一德国人的炸弹误打误撞的正巧落在克林姆林宫呢？“斯大林同志，为稳妥起见您还是……”话音未落，被斯大林摆摆手打断。
可能是因为刚刚发泄完了所有的怒气，现在即使知道莫斯科即将可能被轰炸，斯大林也显得很是从容淡定。“贝利亚同志，你们的情报工作还有纰漏啊。美国人的轰炸机刚在拉脱维亚的秘密机场降落，就遭到德军的轰炸，有这么秘密的吗？”
斯大林的语气很是平淡，可贝利亚的额头上已经渗出密密麻麻的汗水，颤声道。“是我们的工作疏忽，斯大林同志。我一定会把这件事查个水落石出！”见斯大林没有深究的意思，贝利亚心里大大的松了一口气。